《红楼梦》第九十回主要围绕贾宝玉入学、秦钟事件、金荣纠纷及黛玉误会展开，具体内容如下：

一、宝玉入学与秦钟事件（第九回）

宝玉入学准备

宝玉准备入塾学习，袭人帮他收拾行装并劝诫他珍惜学业。宝玉因思念黛玉而未与宝钗告别，引起关注。

秦钟与“香怜”交好

秦钟在学堂与“香怜”（甄英莲）结交，引发贾府远亲金荣的嫉妒。金荣指使秦钟与香怜见面，导致两人被贾府发现。

学堂混战与解决

金荣因被指使与香怜有染，向贾府告状。贾府展开调查，最终金荣因偏袒金荣并激起其他子弟不满而被迫道歉。

二、金荣纠纷与秦可卿病情（第十回）

金荣退学风波

金荣因不满宝玉与秦钟的关系，向贾府母亲金氏抱怨，欲借机占薛家便宜。金氏与贾府小姑子璜大奶奶争执，险些引发诉讼。

秦可卿病情与张友士治疗

秦可卿（贾珍之妻）经期异常，贾府请来名医张友士（冯紫英推荐）诊治。张友士开药方让秦氏服用，但秦可卿病情加重。

尤氏的权谋

尤氏在金氏来访时，借机提及秦可卿的病情，并暗示秦钟在学堂受欺，转移金氏对秦钟的关注。

三、人物关系与情感纠葛

宝玉与黛玉：

黛玉因宝玉对宝钗的偏心产生误会，两人发生争执。宝钗主动提议让黛玉与宝玉同去荣府，缓和矛盾。

宝玉与秦钟：两人在荣府关系缓和，宝玉向黛玉表白心意，进一步推动情感线发展。

四、其他关键信息

茗烟闹事：茗烟因不满贾珍的管教，在学堂外闹事，李贵最终息事宁人。

伏笔与隐喻：第九回通过“蟾宫折桂”等典故，隐喻宝玉的命运与科举无关。

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