复旦大学的学生在考研时，可以选择以下学校：

上海交通大学：

上海交通大学也是一所顶尖高校，其工科专业非常出名，如电子信息、机械工程、材料科学等。该校研究生教育注重理论与实践相结合，拥有先进的实验室和科研平台，为学生提供了良好的学术氛围和实践机会。

南京大学：

南京大学在多个学科领域都有雄厚的师资力量和科研实力，其研究生教育在国内外都享有很高的声誉。

北京大学：

北京大学作为国内顶尖的综合性大学之一，在文、理、工、管等多个学科领域都拥有雄厚的师资力量和科研实力。

华东师范大学：

华东师范大学在师范教育和综合学科方面也有很高的学术水平，该校在教育学、心理学、地理学等领域有深厚的积淀和突出的研究成果。

清华大学：

清华大学是中国顶尖的综合性大学之一，拥有广泛的学科资源和强大的师资力量。

浙江大学：

浙江大学也是国内知名的综合性大学，拥有雄厚的师资力量和科研实力。

山东大学：

山东大学同样是国内知名大学，培养了大量的优秀学生。

上海财经大学：

上海财经大学在财经类专业领域有很高的声誉。

上海外国语大学：

上海外国语大学在语言类专业领域有深厚的积淀。

中国科学技术大学：

中国科学技术大学在科学研究和工程领域有很高的声誉。

同济大学：

同济大学在工程、医学、人文社科等多个领域都有雄厚的师资力量和科研实力。

华东理工大学：

华东理工大学在化工、材料、生物工程等领域有很高的学术水平。

上海大学：

上海大学是上海市属的综合性大学，入选“教育部来华留学示范基地”等。

东华大学：

东华大学在纺织、材料、设计等领域有很高的学术水平。

上海戏剧学院：

上海戏剧学院在戏剧与影视学领域有深厚的积淀。

海军军医大学：

海军军医大学在医学领域有很高的声誉。

上海材料研究所、 上海发电设备成套设计研究院、 上海内燃机研究所、 上海核工程研究设计院、 中国航空研究院等研究所也提供研究生课程。

这些学校都是国内知名的学府，复旦大学的学生可以根据自己的兴趣和职业规划选择合适的学校进行深造。建议在选择学校时，综合考虑学校的学科优势、师资力量、科研平台以及个人兴趣和发展方向。