微生物考研的专业方向相当多样，涵盖了从基础科学研究到应用开发的广泛领域。根据最新的资料，以下是一些主要的考研专业方向：

资源与应用微生物学：

专注于微生物资源的开发、保存、评价和利用。

病源微生物学：

研究病原微生物的生物学特性、致病机制、感染过程及防治方法。

微生物发酵与代谢工程：

研究微生物发酵过程、代谢途径及其调控，以及代谢产物的生产与应用。

生物防治微生物学：

研究利用微生物进行生物防治的理论和技术，包括微生物农药、微生物肥料等。

环境微生物学：

研究微生物与环境之间的相互作用，包括微生物在环境监测、污染治理等方面的应用。

真菌学：

研究真菌的生物学特性、分类、生态、生理、代谢及其在工业、农业、医学等方面的应用。

分子生物学：

研究微生物的遗传物质、基因表达和调控机制。

生物化学：

研究生物体内的化学过程和反应。

生物技术：

应用生物学原理和技术进行产品开发和生产。

海洋生物学：

研究海洋中的微生物及其生态。

植物学：

虽然主要研究植物，但也涉及微生物与植物相互作用的方面。

生理学：

研究微生物的生理功能和代谢过程。

此外，一些学校还会根据自身的研究特色和资源条件，设置一些特色研究方向，例如：

微生物生理生化：研究微生物的生理和生化过程。

微生物遗传与分子生物学：研究微生物的遗传信息和分子机制。

微生物资源与生态：研究微生物资源及其生态系统。

应用微生物与发酵技术：研究微生物在工业发酵中的应用。

资源和环境微生物学：研究微生物在资源开发和环境保护中的应用。

海洋微生物学：研究海洋环境中的微生物。

免疫学：研究微生物与宿主之间的免疫反应。

病原生物学：研究病原微生物的生物学特性和致病机制。

微生物与生化药学：研究微生物在药物开发和生产中的应用。

生物信息学：利用计算机科学和数学方法分析生物学数据。

选择具体的考研专业方向时，建议考生根据自己的兴趣和职业规划，结合各学校的招生专业目录和研究方向，进行综合考虑。