选择南京医学考研的学校时，可以考虑以下几个因素：

学校类型和层次

985高校：南京大学、东南大学。

211高校：苏州大学、江南大学。

双一流高校：南京医科大学、南京中医药大学。

学科实力和排名

南京医科大学在医学类院校中排名不错，综合实力医学能排在十几名，是江苏医学整体实力最强的院校。

南京大学的医学实力相对较弱，但由于其超高院校层次的加持，录取分数很高。

学科特色

如果对特定专业如公共卫生与预防医学感兴趣，南京医科大学是理想选择。

苏州大学医学院在全国医学院校中排名第27，江苏地区排名第2。

南京中医药大学的一流学科是中药学。

地域便利

考虑在江苏省内就读，便于实习和就业，苏州大学、江南大学等也是不错的选择。

就业情况

江苏大学医学院毕业生大多就业于市、县级医院，实际就业率达97%以上。

报考难度

南京医科大学的报考难度可能相对较高，但综合声誉不是非常高。

苏州大学医学院的考研难度适中，适合偏好地区的同学。

个人兴趣和未来职业规划

选择与自己的专业背景和兴趣相符的学校，可以参考最新的招生简章、历年分数线、报录比等信息，进行综合评估。

建议

综合实力强：首选南京医科大学，它在江苏乃至全国都有很高的医学声誉和实力。

学科特色明显：如果对公共卫生与预防医学感兴趣，南京医科大学是理想选择。

综合大学医学部：可以考虑南京大学、东南大学等综合大学的医学部，这些学校整体实力强，医学专业也较为突出。

地域便利：考虑在江苏省内就读，便于实习和就业，苏州大学、江南大学等也是不错的选择。

根据以上信息，你可以根据自己的情况，综合考虑学校声誉、专业特色、地理位置、就业情况等因素，选择适合自己的医学考研院校。