合作院校认证考研的流程如下：

资格审核：

提交报名资料至院校，等待资格审核，一般需要1-2周时间得知结果。

参加入学考试：

考试由招生院校自主命题，通常包括面试和笔试。

课程学习与论文答辩：

学制一般在1.5年-2年左右，学生需完成课程学习并修满学分，通过论文答辩后，可获得国内院校结业证书和国外院校硕士学位证书。

学历学位认证：

所获得的国外学位必须到“中国留学服务中心”进行学历学位认证，认证后其效力相当于国内“研究生学历和学位”。

建议直接咨询意向院校获取最准确的信息，因为具体的报考流程和要求可能因合作院校和项目的不同而有所差异。